Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtcflA2APF3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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