Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hacd4A2AKM2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hacd4A2AKM2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd4A2AKM2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms