Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm13941A2AJ38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm13941A2AJ38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm13941A2AJ38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm13941A2AJ38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm13941A2AJ38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm13941A2AJ38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm13941A2AJ38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms