Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col9a3A2ACT7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a3A2ACT7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms