Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbc1d16A2ABG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d16A2ABG4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tbc1d16A2ABG4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d16A2ABG4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d16A2ABG4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d16A2ABG4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d16A2ABG4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms