Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdr2lA2A6T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdr2lA2A6T1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdr2lA2A6T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms