Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMD3A2A2Y4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMD3A2A2Y4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms