Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEB3A0JP26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms