Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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