Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kif3aP28741 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kif3aP28741 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Kif3aP28741 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Kif3aP28741 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Kif3aP28741 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms