Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb3P09026 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms