Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms