Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms