Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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