Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms