Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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