Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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