Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib2Q9Z309 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib2Q9Z309 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cib2Q9Z309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib2Q9Z309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms