Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms