Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr1Q9Z2C4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtmr1Q9Z2C4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtmr1Q9Z2C4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr1Q9Z2C4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms