Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfxankQ9Z205 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RfxankQ9Z205 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RfxankQ9Z205 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms