Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sept3Q9Z1S5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept3Q9Z1S5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept3Q9Z1S5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept3Q9Z1S5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept3Q9Z1S5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept3Q9Z1S5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept3Q9Z1S5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms