Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VarsQ9Z1Q9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VarsQ9Z1Q9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms