Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfkbiaQ9Z1E3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfkbiaQ9Z1E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms