Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oc90Q9Z0L3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Oc90Q9Z0L3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Oc90Q9Z0L3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Oc90Q9Z0L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms