Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC61Q9Y6R9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC61Q9Y6R9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC61Q9Y6R9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms