Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
MAP3K4Q9Y6R4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
MAP3K4Q9Y6R4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms