Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG1Q9Y678 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPG1Q9Y678 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG1Q9Y678 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms