Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRPRBQ9Y5M8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRPRBQ9Y5M8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRPRBQ9Y5M8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRPRBQ9Y5M8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms