Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAPGEF2Q9Y4G8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.07
RAPGEF2Q9Y4G8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF2Q9Y4G8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms