Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXND1Q9Y4D7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXND1Q9Y4D7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms