Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
THRAP3Q9Y2W1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
THRAP3Q9Y2W1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
THRAP3Q9Y2W1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms