Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP8A1Q9Y2Q0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms