Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A6Q9Y2P4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A6Q9Y2P4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A6Q9Y2P4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms