Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS9D1Q9Y2B5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS9D1Q9Y2B5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms