Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARSAQ9Y285 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARSAQ9Y285 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARSAQ9Y285 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms