Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NUDCQ9Y266 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NUDCQ9Y266 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms