Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carm1Q9WVG6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Carm1Q9WVG6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Carm1Q9WVG6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms