Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec2Q9WV35 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec2Q9WV35 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms