Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc1bQ9WV32 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc1bQ9WV32 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc1bQ9WV32 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc1bQ9WV32 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc1bQ9WV32 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arpc1bQ9WV32 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms