Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SPG7Q9UQ90 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPG7Q9UQ90 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SPG7Q9UQ90 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
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