Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB2Q9UPW6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms