Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CEP164Q9UPV0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CEP164Q9UPV0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CEP164Q9UPV0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CEP164Q9UPV0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
CEP164Q9UPV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CEP164Q9UPV0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms