Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4AQ9UPU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD4AQ9UPU9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms