Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SORCS3Q9UPU3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms