Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF18Q9UNG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms