Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM4Q9ULL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
SHROOM4Q9ULL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.15
SHROOM4Q9ULL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC47.13■■■■■ 5.14
SHROOM4Q9ULL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
SHROOM4Q9ULL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms