Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF346Q9UL40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF346Q9UL40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms