Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms