Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PARP4Q9UKK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PARP4Q9UKK3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PARP4Q9UKK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PARP4Q9UKK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms